Au sein du Groupe EUROFINS, l’un des leaders mondial sur le marché des services bio-analytiques, la division ‘‘Clinical Diagnostics’’ contribue au bien-être et à la santé de tous en fournissant à ses clients des services d'analyse et de conseil de haute qualité.

Toute l’activité du groupe est tournée vers l’excellence, l’innovation et l’investissement technologique, à l’instar des laboratoires de référence sur la scène internationale. Les laboratoires du groupe, qui réalisent un panel très large d’examens de biologie médicale, ont fondé leur réputation sur le développement continu de nouveaux tests et la réalisation d’examens à forte valeur ajoutée médicale.

Au sein d’Eurofins Biomnis et dans le cadre du déploiement de notre activité, nous recherchons pour notre BU Séquençage, un CDD de 12 mois, un(e) : BIO-INFORMATICIEN  H/F

Vous serez, en collaboration avec les autres bioinformaticiens du laboratoire, notamment en charge de :

• Assurer le développement, la validation et le bon déroulement des pipelines d’analyses, de la récupération des données brutes à la livraison des résultats aux cliniciens et porteurs de projets dans le cadre des activités de diagnostic et de recherche;

• Participer à la conception, au développement et à l’optimisation de l’architecture informatique et des outils permettant le calcul intensif et le stockage des données génétiques ;

• Assurer le recueil et la spécification des besoins pour l’activité de diagnostic clinique ;

• Assurer le paramétrage et la maintenance des SGL de biologie clinique et de génétique ;

• Evaluer les outils bio-informatiques existants et apporter des nouvelles solutions pour l’analyse des données de séquençage ;

• Mettre en place et/ou adapter la documentation du système bio-informatique d’analyse des données NGS de routine pour le faire rentrer dans la norme (ISO 15189, COFRAC) ;

• Contribuer aux démarches de traçabilité.

De Formation Bac+3 à Bac+5 en Bio-informatique, vous disposez de connaissance en biologie moléculaire et en analyse de données de séquençage haut-débit (NGS).

La maitrise d’un langage de programmation (R, Python ou Java) et d’un interprétateur de commandes (Bash/Shell) est indispensable. La maitrise du gestionnaire de workflow Nextlow sera appréciée.

Des connaissances en administration de serveur Unix seront fortement appréciées.

Doté d'un fort esprit d'analyse et de synthèse, vous êtes reconnu(e) pour votre rigueur et votre organisation. Vous êtes force de proposition, vous savez travailler en autonomie et vous intégrer dans une équipe pluridisciplinaire.

Votre capacité à collaborer, votre esprit d’équipe et votre sens du relationnel seront des atouts appréciés.

La maitrise de l’anglais serait un plus.

Localisation : Lyon 07

CDD - 12 mois

Rémunération / Avantages : Salaire brut mensuel selon profil et expérience

Date d'intégration souhaitée : janvier 2019